En mi recien instalado Ubuntu necesite ahora hacer FTP al server. Yo en windows estoy usando el WinSCP y ahora buscando algo similar en linux encontre que el ubuntu me instala por default el Nautilus como navegador de folders.
Con el mismo nautilus puedo hacer sftp.
simplemente voy a File => Connect to Server... y ahi elijo SSH y listo.

Nautilus es la aplicación de Gnome que permite manejar a los usuarios el sistema de ficheros de forma gráfica.
Esta diseñado de forma que sea muy sencillo instalarle scripts, dotándole a éste de una mayor funcionalidad.

Nautilus Scripts (http://g-scripts.sourceforge.net/)

Espero que les sirva
Salu2

Para los que usan gnome con nautilus en español pueden acceder desde Lugares -> Conectar con el Servidor.